Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Phf6Q9D4J7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms