Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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