Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cfap53Q9D439 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cfap53Q9D439 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cfap53Q9D439 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cfap53Q9D439 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap53Q9D439 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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