Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms