Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nip7Q9CXK8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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