Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms