Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Use1Q9CQ56 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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