Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnaseh2cQ9CQ18 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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