Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bhlhe41Q99PV5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms