Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms