Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdac9Q99N13 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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