Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd1Q99MV1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tdrd1Q99MV1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Tdrd1Q99MV1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms