Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms