Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms