Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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TrabdQ99JY4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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