Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms