Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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