Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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