Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ctu1Q99J10 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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