Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf144aQ925F3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf144aQ925F3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf144aQ925F3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf144aQ925F3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf144aQ925F3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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