Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim59Q922Y2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms