Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms