Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms