Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcsapQ8QZT2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms