Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxc12Q8K5B8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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