Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms