Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf628Q8CJ78 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms