Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms