Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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