Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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