Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 S100a16-203ENSMUST00000107331 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm28436-201ENSMUST00000186307 698 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms