Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rbbp5Q8BX09 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp5Q8BX09 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms