Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms