Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms