Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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