Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms