Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ChfrQ810L3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ChfrQ810L3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ChfrQ810L3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ChfrQ810L3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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ChfrQ810L3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms