Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms