Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClmQ7TSN2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms