Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms