Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Uhrf2Q7TMI3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms