Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms