Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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