Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms