Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Tpm4Q6IRU2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Tpm4Q6IRU2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tpm4Q6IRU2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tpm4Q6IRU2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tpm4Q6IRU2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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