Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms