Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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