Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms