Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ecm1Q61508 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ecm1Q61508 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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