Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms